Systèmes de défense et de contre-défense entre bactéries et phages

Allergology and Immunology

Les bactéries ont développé différents systèmes de défense pour se protéger des infections par les phages. Réciproquement, les phages ont développé des systèmes de contre-défense pour contourner les systèmes de défense mis en œuvre par les bactéries. Dans cette étude, les chercheurs ont utilisé des analyses de similarité structurelle des protéines et de co-occurrence de gènes pour cribler plus de 66 millions de séquences de protéines virales et plus de 300 000 génomes assemblés par métagénome. Ils ont ainsi pu accéder aux mécanismes d’interaction entre hôte et phages. Ils ont identifié notamment la protéine Acr du phage Bacteroidota qui inhibe Cas12a, et une protéine de défense anti-phages d’Akkermansia muciniphila, appelée BxaP. Le gène bxaP se trouve dans les loci codant pour l’exclusion des bactériophages et les systèmes de défense par restriction-modification.

Source(s) :
Ning Duan et al. Structure-guided discovery of anti-CRISPR and anti-phage defense proteins. Nat Commun. 2024 Jan 20;15(1):649. ;

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