Les troubles atopiques primaires (TAP) sont des troubles monogéniques causés par des variants pathogènes de gènes codant pour des protéines essentielles au maintien d'une barrière cutanée saine et à un système immunitaire performant.
Les médecins sont confrontés au défi de trouver des patients/familles atteints de TAP uniques et extrêmement rares parmi les millions d'individus atteints de maladies allergiques communes.
Les auteurs décrivent des scénarios de cas avec des TAP caractéristiques. Ils ont passé en revue la littérature et en ont déduit des signaux d'alerte cliniques spécifiques pour la détection des TAP. Il s'agit notamment d'antécédents familiaux positifs et/ou de signes de susceptibilité pathologique aux infections, d'immunodysrégulation ou de maladie syndromique.
Les résultats des analyses de laboratoire conventionnelles et de la plupart des études immunologiques ne sont pas suffisants pour établir un diagnostic définitif de TAP. Par le passé, la réduction en plusieurs étapes des diagnostics différentiels par divers tests immunologiques et autres tests de laboratoire conduisait à tester des gènes uniques ou des analyses de panels de gènes, une approche qui prenait beaucoup de temps et souvent infructueuse.
La mise en œuvre d'analyses génomiques complètes dans les diagnostics de routine a entraîné un changement de paradigme. L'analyse en amont du génome entier par séquençage (WGS) raccourcira le délai de diagnostic, évitera aux patients des investigations inutiles et réduira la morbidité et la mortalité.
Les auteurs proposent une approche rationnelle, basée sur des repères cliniques, pour décider quels cas passent le filtre de l'analyse précoce du génome entier.
L'interprétation des résultats de la WGS requiert une grande prudence quant à la relation causale des variantes dans les phénotypes des TAP et à l'absence de preuve par des tests fonctionnels adéquats. En cas de résultats négatifs de la WGS, une attitude de réitération avec de nouvelles analyses des données (en utilisant les dernières annotations de la base de données) peut éventuellement conduire au diagnostic des TAP.
Les TAP, comme beaucoup d'autres maladies génétiques rares, ne seront gérés avec succès que si des médecins de différentes spécialités cliniques et des généticiens interagissent régulièrement dans le cadre de conférences multidisciplinaires.
